Ir. A.H.J. Wittenberg : "Diversity Arrays Technology (DArT): een schot in de roos"

  Nieuws
  Perskamer
  Archief
  Agenda
  2012
  2011
  2010
  2009
  2008
  2007
  2006
  2005
  2004
  2003
  2002
  2001
  2000
  1999
  Nieuws
  RSS
  Agenda
  Open dagen
  Cursussen
  Promoties & Oraties
  Congressen en symposia

16 mrt 2007 13:30
Onderdeel: Wageningen Universiteit
Locatie: Aula, gebouw 362, Gen. Foulkesweg 1, Wageningen
Organisatie: Wageningen Universiteit
Promotor: prof.dr. R.G.F. Visser (Pers. hgl. bij het lab. voor Plantenveredeling)
Co-Promotor: Dr.ir. H.J. Schouten, Dr. T.A.J. van der Lee

 Diversity Arrays Technology (DArT): een schot in de roos

Het opsporen van verschillen in DNA-sequentie, ook wel merkers genoemd, tussen verwante organismen vormt de basis voor veel genetisch onderzoek. Er zijn veel methoden om merkers op te sporen en te scoren. Bestaande merkermethoden hebben echter een aantal beperkingen. Ze kunnen slechts een gering aantal merkers tegelijk bepalen, of vooraf is DNA-sequentieïnformatie noodzakelijk. Ook zijn ze vaak relatief duur. De nieuw ontwikkelde merkermethode Diversity Arrays Technology (DArT) is een op microarray gebaseerde methode en heeft deze beperkingen niet. De methode levert snel en goedkoop grote aantallen zeer betrouwbare merkers. Dat bleek tijdens bij het maken van twee hoge-dichtheidskaarten voor de schimmel Mycosphaerella graminicola, de veroorzaker van de bladvlekkenziekte in tarwe. M.b.v. DArT konden ruim 2000 merkers op de chromosoomkaarten geplaatst worden. De merkers zijn gesequenced en hebben geholpen bij de assemblage van de complete genoomsequentie van deze schimmel. Mede hierdoor is M. graminicola nu de eerste schimmel waarvan een volledige genoomsequentie van telomeer tot telomeer beschikbaar is. De keuze voor de toepassing van DArT in de schimmel M. graminicola was dan ook een schot in de roos.


Titel proefschrift: "Genetic mapping using the Diversity Arrays Technology (DArT) – Application and validation using the whole-genome sequences of Arabidopsis thaliana and Mycosphaerella graminicola"
Print dit agenda item

Meer over dit onderwerp
  Directe internet uitzending van de promotie