Dhr. B.F.T. (François) Alako: "(“knowledge discovery”) in de moleculaire biologie met behulp van bioinformatica technieken"

  Nieuws
  Perskamer
  Archief
  Agenda
  2012
  2011
  2010
  2009
  2008
  2007
  2006
  2005
  2004
  2003
  2002
  2001
  2000
  1999
  Nieuws
  RSS
  Agenda
  Open dagen
  Cursussen
  Promoties & Oraties
  Congressen en symposia

1 feb 2008 16:00
Onderdeel: Wageningen Universiteit
Locatie: Aula, gebouw 362, Gen. Foulkesweg 1, Wageningen
Organisatie: Wageningen Universiteit
Promotor: prof.dr. J.A.M. Leunissen (Bio-informatica)

 In dit proefschrift worden verschillende benaderingen beschreven om de exponentieel groeiende data stroom in de levenswetenschappen te exploiteren. Twee velden uit de moleculaire biologie worden aangesproken, de sequentie analyse en tekst analyse.
Het eerste onderwerp richt zich op het probleem van de verwantschap van eiwitten, vooral wanneer de onderlinge overeenkomsten erg gering zijn. Hiervoor is een visualisatie programma ontwikkeld dat sequentie alignment, eiwit domein voorspelling en fylogenie combineert.
Het tweede hoofdonderwerp van dit proefschrift, text mining, spreekt het probleem aan hoe een zoekvraag in de literatuur zo efficiënt en eenduidig mogelijk geformuleerd kan worden. Hierbij wordt in het bijzonder het probleem van de gen-symbool ambiguïteit geadresseerd: 50% van de gen-symbolen is niet eenduidig, en kan dus meer dan een gen of eiwit familie aanwijzen. De nieuw ontwikkelde methode kan door gebruik te maken van tekst clustering en taxonomische informatie dit probleem in vrijwel alle gevallen eenduidig oplossen.

Titel proefschrift: "An integrative algorithmic approach towards knowledge discovery in Bioinformatics"
Print dit agenda item

Meer over dit onderwerp
  Directe internet uitzending van de promotie