14 apr 2009 16:00
Onderdeel:
Wageningen Universiteit
Locatie:
Aula, gebouw 362, Gen. Foulkesweg 1, Wageningen
Organisatie:
Wageningen Universiteit
Promotor:
prof.dr. W.M. de Vos (Microbiologie)
Promotor:
Prof.dr. M. Kleerebezem (NIZO, Ede)
Co-Promotor:
Dr. E.G. Zoetendal
Analyse van de diversiteit en functie van de bacteriën in de menselijke dunne darm
De focus van het onderzoek beschreven in dit proefschrift is op de bacteriën die leven in de dunne darm van volwassen mensen. De dunne darm begint meteen na de maag, en gaat na ongeveer zeven meter bij de blinde darm over in de dikke darm.
Bij de start van mijn promotie-onderzoek richtte veel onderzoek aan de microbiota van het menselijke maagdarmkanaal zich op de dikke darm, waarbij feces gebruikt werd als uitgangsmateriaal om de bacterie-samenstelling te onderzoeken. Bij aanvang van dit project was de samenstelling van de microbiota in de dunne darm nauwelijks beschreven. Dit komt met name doordat het erg lastig is om representatieve monsters te krijgen uit de dunne darm. Via de mond moeten eerst de slokdarm en de maag gepasseerd worden, terwijl er via de anus een lange weg door de dikke darm afgelegd moet worden. Daardoor is het verkrijgen van materiaal uit de dunne darm erg invasief voor de vrijwilliger.
Om monsters uit de dunne darm te verkrijgen hebben we mensen met een ileostoma benaderd. De inhoud van de dunne darm, het effluent is gebruikt om de bacterie-samenstelling in de dunne darm te bepalen en daarnaast om de functionaliteit van de bacteriën te onderzoeken. Het grote voordeel van het gebruik van ileostoma effluent is dat dit materiaal erg makkelijk verkregen kan worden zonder dat de persoon in kwestie daar hinder van ondervindt. Bovendien is het mogelijk om over een langere periode monsters te verzamelen.
De resultaten uit dit onderzoek tonen aan dat Streptococcus en Veillonella de dominante soorten in de microbiota van de dunne darm zijn. Bovendien blijkt Streptococcus zeer actief te zijn, met name in het opnemen en omzetten van suikers. Verder treden er grote fluctuaties op in de microbiota van de dunne darm, zelfs binnen één dag. Deze fluctuaties lijken echter rondom een stabiele kerngroep te schommelen, welke in ieder van de onderzochte personen aanwezig is.