Wageningen University doet onderzoek binnen het domein ‘gezonde voeding en leefomgeving’. Al het universitair onderzoek wordt uitgevoerd onder verantwoordelijkheid van onderzoekscholen die de kwaliteit van het onderzoek garanderen.
Het onderzoek wordt gedaan door 92leerstoelgroepen, die elk onder leiding staan van een hoogleraar. Een Algemene Instellingsgebonden Ethische Commissie stelt ethische richtlijnen op voor het onderzoek. Financiering is afkomstig van de overheid of van onderzoeksorganisaties zoals de Nederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk Onderzoek (NWO) en de Koninklijke Nederlandse Academie van Wetenschappen (KNAW) en van particuliere stichtingen en het bedrijfsleven.